講談社が2009年から2012年にかけて刊行した全200巻の文庫版漫画全集で、手塚治虫生誕80周年を記念した企画です。『手塚治虫漫画全集』（全400巻）を再編集し、未収録作品を盛り込んだ“21世紀版全集”として位置づけられています。
※BT番号は『手塚治虫文庫全集』の管理番号です。一般には“Bunko Tezuka”の略と理解されています。
MW（ムウ）
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エピソード一覧：
- 第20章 倒錯
- 第21章 エピソード
- 第22章 仮面の訪問
- 第23章 R基地に悪魔が来た
- 第24章 人質
- 第25章 破滅への出発
- 第26章 最後の賭
火の山
ペーター・キュルテンの記録
もの憂げな夜
ラインの館にて
ナスビ女王
とんから谷物語
そよ風さん
ひまわりさん
新世界ルルー
黄金都市
タイガー博士
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エピソード一覧：
- 王は6才なりき
- 野球をしらない国
- 魔法野球戦
- サバクの危難
- へんな蜜袋
- しあわせなき国
- きかいでくらす国
- きかいのつかえない国
くるったジャングル
氏神さまの火
村の踊り子
足あと温泉
カノコの応援団長
凸凹牧場
凸凹剣士
ばるぼら
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エピソード一覧：
- 第1章 デパートの女
- 第2章 女と犬
- 第3章 黒い広場
- 第4章 秘密
- 第5章 砂丘の悪魔
- 第6章 黒い破戒者
- 第7章 狼は鎖もて繋げ
- 第8章 複製
- 第9章 狂気の世界
- 第10章 ブードゥー
- 第11章 黒ミサ
- 第12章 回帰
- 第13章 宣告
- 第14章 霧の中のパトス
- 第15章 大団円
0マン
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エピソード一覧：
- 第1章 シッポのはえた少年
- 第2章 雪男の秘密
- 第3章 エンマ登場す！
- 第4章 替え玉首相
- 第5章 地底工場の怪人
- 第6章 警告
- 第7章 密輸船
- 第8章 0マンの国へ
- 第9章 大僧官
- 第10章 三匹の雪男
- 第11章 父と子
- 第12章 田手上博士の変調
- 第13章 人造細胞
- 第14章 大噴火
- 第15章 狂った吹雪
- 第16章 零下273度
- 第17章 さらわれたママ
- 第18章 ワナ
- 第19章 爆発10分前
- 第20章 ムームーの日
- 第21章 少女リーズ
- 第22章 世界はふるえる
- 第23章 ゴーストタウンの決闘
- 第24章 とらえられた人々
- 第25章 コヨーテの群れ
0マン
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エピソード一覧：
- 第26章 脱走者
- 第27章 地球よ さらば
- 第28章 宣戦
- 第29章 人質
- 第30章 死の会議
- 第31章 縦穴牢の隠者
- 第32章 雪どけ
- 第33章 大洪水
- 第34章 革命
- 第35章 金星のリス人間
- 第36章 とらわれのふたり
- 第37章 日本の変貌
- 第38章 ピット来たる
- 第39章 アメリカ基地にて
- 第40章 ふたたび日本基地
- 第41章 平和使節
- 第42章 ブッコ・ワース光線
- 第43章 ドンペイがんばる
- 第44章 大僧官の最期
- 第45章 エピローグ
ブッキラによろしく！
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エピソード一覧：
- 第1話 なぜ13号スタジオ
- 第2話 夜明けのデート
- 第3話 ルポライターはつらいよ
- 第4話 最初のなぐりこみ
- 第5話 ブッキラのなぞに挑戦
- 第6話 猿の手
- 第7話 ピアノイドの家
- 第8話 呪いの100円玉
- 第9話 迷子島の囚人
牙人
オズマ隊長
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エピソード一覧：
- プロローグ
- 第1話 ユダ結社
- 第2話 ヒューマノイド・チル
- 第3話 放射能ヤドカリ
- 第4話 モンテ・クリスト星
- 第5話 オバケ植物事件
- 第6話 超音波車ミリー
オズマ隊長
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エピソード一覧：
- 第7話 電子頭脳ゴルゴン
- 第8話 八八八八号衛星
- 第9話 地底探検
- 第10話 奇術王ムリダー
- 第11話 ドッグ・マン
- 第12話 宇宙オリンピック
ブルンガ1世
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エピソード一覧：
- 第1章 悪魔の誕生
- 第2章 悪魔の正義
- 第3章 悪魔の奴隷
- 第4章 悪魔の対決
- 第5章 悪魔の恋人
- 第6章 悪魔のいけにえ
- 第7章 ガノモスの最後
- 第8章 ブルンガ二世
- 第9章 影沢商事の怪物
- 第10章 悪魔は滅びない
ノーマン
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エピソード一覧：
- 第1章 オープニング
- 第2章 霧のかなた
- 第3章 怪傑ベガー少佐
- 第4章 ミレヨ大尉を生かすな！
- 第5章 アローデの休日
- 第6章 プリズナー
- 第7章 ママを譲れ！
- 第8章 ゴースト・ムーン作戦
- 第9章 裏切り者
ミクロイドS
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エピソード一覧：
- 第1章 サバクの果てしなき果て
- 第2章 人類の凍れるまなざし
- 第3章 ギドロンの死の尖兵
- 第4章 ただひとりの味方
- 第5章 待ち伏せ
- 第6章 大襲来の夜
- 第7章 ホテルにて
- 第8章 死体の街を行く
- 第9章 蛾にあやつられる少女
- 第10章 奥秩父ダムの悲劇
- 第11章 廃墟の東京
ミクロイドS
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エピソード一覧：
- 第12章 生ける人形たち
- 第13章 パニック
- 第14章 再来襲の夜
- 第15章 野郎たちと女ども
- 第16章 死の雲の下で
- 第17章 いろは坂の惨劇
- 第18章 ジガーの最後
サンダーマスク
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エピソード一覧：
- 第1章 プロローグ
- 第2章 バイブル
- 第3章 デカンダー
- 第4章 オミクロン
- 第5章 エピローグ
地球を呑む
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エピソード一覧：
- 第1章 プレリュード
- 第2章 テーマのためのプロローグ
- 第3章 モチーフ（1）
- 第4章 モチーフ（2）
- 第5章 展開へのアプローチ
- 第6章 ライト・モチーフ
- 第7章 展開（1）
- 第8章 展開（2）
- 第9章 展開（3）
- 第10章 アレグロ・ウン・ポコ・ソステヌート
- 第11章 バリエーションへのアプローチ
- 第12章 スケルツォ
- 第13章 アダジオ・モデラート
- 第14章 バルス・ラプソディー
- 第15章 インテルメッツォ
- 第16章 フーガ
- 第17章 メヌエット
- 第18章 ポロネーズ・メランコリック
- 第19章 プレスト・パセティック
- 第20章 コーダ
陽だまりの樹
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エピソード一覧：
- 第1章 三百坂
- 第2章 おせき殿
- 第3章 鬼鉄
- 第4章 曾根崎新地
- 第5章 腑分け
- 第6章 適塾の人々
- 第7章 星鶴 豆鶴
- 第8章 夜の客人
- 第9章 嵐の前
- 第10章 天地鳴動
- 第11章 老中・阿部
- 第12章 抜擢
陽だまりの樹
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エピソード一覧：
- 第13章 除痘館
- 第14章 男子の本懐
- 第15章 下田の夏
- 第16章 薄芒野の決闘
- 第17章 唐人お吉（その一）
- 第18章 唐人お吉（その二）
- 第19章 韮山紀行
- 第20章 千鳥ケ淵の対決
- 第21章 万二郎よろめく
- 第22章 想われる者
陽だまりの樹
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エピソード一覧：
- 第23章 七化けお紺
- 第24章 縁組
- 第25章 難題
- 第26章 使節江戸へ
- 第27章 本陣待ち伏せ
- 第28章 将軍のいちばん長い日
- 第29章 裏切り者
- 第30章 西郷登場
- 第31章 巻き添え
- 第32章 やけ酒万二郎
- 第33章 東京大学事始め
- 第34章 コロリ参上
陽だまりの樹
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エピソード一覧：
- 第35章 その前夜
- 第36章 投獄
- 第37章 死出の旅路
- 第38章 水戸路を行く
- 第39章 炎上
- 第40章 吹きすさぶ嵐
- 第41章 咸臨丸出発
- 第42章 万延元年三月
- 第43章 丑三つの決闘
- 第44章 ヒュースケン帰る
陽だまりの樹
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エピソード一覧：
- 第45章 ヒュースケン暗殺
- 第46章 良仙逝く
- 第47章 テロリストの夜
- 第48章 永沢村異聞
- 第49章 農兵節
- 第50章 浪士組結成
- 第51章 恩師江戸入り
- 第52章 宝珠を切る
- 第53章 天網恢恢
- 第54章 真忠組
- 第55章 暁の急襲
- 第56章 愛憎の館
陽だまりの樹
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エピソード一覧：
- 第57章 長州行
- 第58章 鬼
- 第59章 ええじゃないか
- 第60章 大政奉還
- 第61章 官軍江戸入り
- 第62章 万二郎婚礼
- 第63章 上野輪王寺
- 第64章 終章
サロメの唇
最上殿始末
新聊斎志異 叩建異譚
I．L（アイエル）
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エピソード一覧：
- 第1章 箱の女
- 第2章 蛾
- 第3章 メッセンジャー
- 第4章 フラレルノ大統領の宝
- 第5章 ブロッケンの妖怪
- 第6章 身代金
- 第7章 フーテン芳子の物語
- 第8章 マネキン
- 第9章 栄光の掟
- 第10章 封蠟
- 第11章 南からきた男
- 第12章 ラスプーチン
- 第13章 眼
- 第14章 ハイエナたち
ステロタイプ
タカラジマ
バット博士とジム
怪人コロンコ博士
Qチャンの捕物帳
ハンスと金のかみのけ
ドローン城物語
ワン公月へ行く
おばけジャングル
鳥よせ少女
みす・たからずか
びいこのおもり
すずむしひめ
かりゅうどばちのおはなし
ファーブル先生の虫物語
くろちょろのぼうけん
いのちの豆じしゃく
ぼくはにんじゅつつかい
ちらかしくん
火星物語
人間のせんぞ
ピロンちゃん
奇妙な大旅行
ふたりの演奏家
太陽がさかさまだ
野ばらよいつ歌う
幽靈男
『幽靈男』作品ページへ
エピソード一覧：
- 破壊蟲
- 黑い魔物
- 威嚇人形
- 危機一髪
- 幽靈を見た男
- 人造人間プポ氏
- 溶熱室
- 博士の追跡
- 奇々怪々
- 毒盃（惡魔の陳述）
- 毒蛇姫
- オヤヂ奮闘
勝利の日まで
『勝利の日まで』作品ページへ
エピソード一覧：
- 空襲警報
- 防空情報
- 退避！！
- 機銃掃射
- 燒夷攻撃
オヤヂの宝島
『オヤヂの宝島』作品ページへ
エピソード一覧：
- 第1章 （原稿紛失のためタイトル不明）
- 第2章 スプレックルスヴィルの酒場
- 第3章 吸血サム
- 第4章 惨殺死体
- 第5章 暗黒街
- 第6章 謀は密なるを以て宜とす
- 第7章 火焙
- 第8章 （タイトル不明）
- 第9章 地下牢の囚人
- 第10章 裏の裏の裏
ふしぎなメルモ
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エピソード一覧：
- ミラクル・キャンデーの巻
- バレリーナの巻
- 白鳥の巻
- やってきたおばさんの巻
- おでかけの巻
- 箱の中の毛虫の巻
- カエル天使の巻
- 林の妖精の巻
- 捨てネコの巻
- 潮干狩りの巻
- 運動会の巻
- 赤ん坊になったメルモちゃんの巻
- ブルドックの巻
- テレビのディレクターの巻
- 婦人警官の巻
- 学芸会の巻
- 花嫁さんの巻
- 山火事の巻
- 雪国のぶら子ちゃんの巻
ぽっかち
カンパチ
パンサーを探せ
ワンサくん
海のトリトン たのしい幼稚園版
ちっぽくんこんにちは 絵本版
ちっぽくんこんにちは 二年の学習～三年の学習版
新寶島オリジナル版
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エピソード一覧：
- 冒險の海え
- 海賊船
- 首領ボアール
- 嵐の一夜
- 漂流
- 絶海の孤島
- おとし穴
- 千古の密林
- ボアール出現
- 渦巻く激流
- 人か？猿か？
- 大鷲山
- 人喰人種
- わけまえ
- 天罰
- バロンの生立
- さらば宝島