講談社が2009年から2012年にかけて刊行した全200巻の文庫版漫画全集で、手塚治虫生誕80周年を記念した企画です。『手塚治虫漫画全集』（全400巻）を再編集し、未収録作品を盛り込んだ“21世紀版全集”として位置づけられています。
※BT番号は『手塚治虫文庫全集』の管理番号です。一般には“Bunko Tezuka”の略と理解されています。
エピソード一覧：
- 第1章 おとこはつらいよ
- 第2章 エクトプラズム
- 第3章 うらめしやこんにちは
- 第4章 マリアのバーベキュー
- 第5章 B・Gクラブ
- 第6章 ユウレイはふとりすぎ
- 第7章 おとこの花道
- 第8章 番外地の花嫁
- 第9章 脱獄の二十四時間
- 第10章 マリア受難の記
- 第11章 対決もあるでよ
- 第12章 バイ・バイ・マリア
エピソード一覧：
- 発端-19XX年
- ヒドロ博士所有权に破れること
- ディモン探検隊出発の瞬間
- おきまりのコースながら話の順序として
- 死と静寂の星
- ディモンにおける植物の群生
- 大助の奇怪なる体験
- 土にもときに生命を授くることあり
- 石油海
- 鳥人は火を使う道を心得ぬこと
- 鳥人についてのロックの記録より
- 大助の行方が知れ ロックとめぐりあう事
- 大助 鳥人について考えをあらためる事
- デコーン現象
- オイル卿の遺産と㐧2の計画
- 鳥人・文化の階段を上る
- 㐧二次探檢隊はなぜ去ったか
- 地球への道
- 鳥人狩
- 鳥人会社
- 鳥人の反乱
- 大團円
エピソード一覧：
- 蜘蛛島の巻
- 海流発電の巻
- 電氣ボールの巻
- ニシキヘビの巻
エピソード一覧：
- 第1場 プロローグ
- 第2場 ふたごのひみつ
- 第3場 森の中
- 第4場 ビオレッタのかなしみ
- 第5場 しろい王子とくろい王子
- 第6場 パピのみたもの
- 第7場 北の塔
- 第8場 ジプシーの女王
- 第9場 みがわりデージィ
- 第10場 ばらの館
- 第11場 水ぜめ
- 第12場 あらし
- 第13場 かげろうの森
- 第14場 チルンのまごころ
- 第15場 オオカミの山
- 第16場 エピローグ
エピソード一覧：
- 3つの箱
- ちかいの夜
- ベニス法廷の場
エピソード一覧：
木の芽（作品ページへ）
発作（作品ページへ）
その子を殺すな！（作品ページへ）
誘拐（作品ページへ）
万引き犬（作品ページへ）
灰とダイヤモンド（作品ページへ）
パク船長（作品ページへ）
白葉さま（作品ページへ）
ときには真珠のように（作品ページへ）
ピノコ生きてる（作品ページへ）
化身（作品ページへ）
閉ざされた三人（作品ページへ）
獅子面病（作品ページへ）
ある教師と生徒（作品ページへ）
なにかが山を……（作品ページへ）
ふたりのジャン（作品ページへ）
ピノコ還る！（作品ページへ）
純華飯店（作品ページへ）
焼け焦げた人形（作品ページへ）
赤ちゃんのバラード（作品ページへ）
誤診（作品ページへ）
目撃者（作品ページへ）
エピソード一覧：
白いライオン（作品ページへ）
恐怖菌（作品ページへ）
光る目（作品ページへ）
電話が三度なった（作品ページへ）
二つの愛（作品ページへ）
めぐり会い（作品ページへ）
ちぢむ！！（作品ページへ）
人面瘡（作品ページへ）
はるかなる国から（作品ページへ）
アリの足（作品ページへ）
ストラディバリウス（作品ページへ）
ふたりの黒い医者（作品ページへ）
ブラック・クイーン（作品ページへ）
にいちゃんをかえせ！！（作品ページへ）
コルシカの兄弟（作品ページへ）
針（作品ページへ）
ネコと庄造と（作品ページへ）
オオカミ少女（作品ページへ）
のろわれた手術（作品ページへ）
火と灰の中（作品ページへ）
ふたりのピノコ（作品ページへ）
エピソード一覧：
えらばれたマスク（作品ページへ）
ガス（作品ページへ）
からだが石に……（作品ページへ）
けいれん（作品ページへ）
イレズミの男（作品ページへ）
こっぱみじん（作品ページへ）
なんという舌（作品ページへ）
スター誕生（作品ページへ）
ドラキュラに捧ぐ（作品ページへ）
地下壕にて（作品ページへ）
弁があった！（作品ページへ）
ピノコ・ラブストーリー（作品ページへ）
宝島（作品ページへ）
ハローCQ（作品ページへ）
地下水道（作品ページへ）
デベソの達（作品ページへ）
かりそめの愛を（作品ページへ）
絵が死んでいる！（作品ページへ）
満月病（作品ページへ）
報復（作品ページへ）
おばあちゃん（作品ページへ）
エピソード一覧：
執念（作品ページへ）
殺しがやってくる（作品ページへ）
霧（作品ページへ）
青い恐怖（作品ページへ）
研修医たち（作品ページへ）
てるてる坊主（作品ページへ）
あるスターの死（作品ページへ）
夜明けのできごと（作品ページへ）
戦場ヶ原のゴリベエ（作品ページへ）
震動（作品ページへ）
きたるべきチャンス（作品ページへ）
畸形嚢腫パート2（作品ページへ）
湯治場の二人（作品ページへ）
盗難（作品ページへ）
空からきた子ども（作品ページへ）
金！金！金！（作品ページへ）
霊のいる風景（作品ページへ）
99.9パーセントの水（作品ページへ）
昭和新山（作品ページへ）
落としもの（作品ページへ）
エピソード一覧：
一ぴきだけの丘（作品ページへ）
小うるさい自殺者（作品ページへ）
命を生ける（作品ページへ）
ある老婆の思い出（作品ページへ）
二人三脚（作品ページへ）
二人目がいた（作品ページへ）
腫瘍狩り（作品ページへ）
ゴーストタウンの流れ者（作品ページへ）
浮世風呂（作品ページへ）
終電車（作品ページへ）
すりかえ（作品ページへ）
助け合い（作品ページへ）
20年目の暗示（作品ページへ）
がめつい同士（作品ページへ）
消えさった音（作品ページへ）
海は恋のかおり（作品ページへ）
山猫少年（作品ページへ）
しめくくり（作品ページへ）
ブラック・ジャック病（作品ページへ）
落下物（作品ページへ）
エピソード一覧：
家出を拾った日（作品ページへ）
未知への挑戦（作品ページへ）
ある女の場合（作品ページへ）
人形と警官（作品ページへ）
鳥たちと野郎ども（作品ページへ）
山小屋の一夜（作品ページへ）
裏目（作品ページへ）
コレラさわぎ（作品ページへ）
山手線の哲（作品ページへ）
戦争はなおも続く（作品ページへ）
カプセルをはく男（作品ページへ）
黒潮号メモ（作品ページへ）
ピノコ・ミステリー（作品ページへ）
もらい水（作品ページへ）
密室の少年（作品ページへ）
動けソロモン（作品ページへ）
ポケットモンキー（作品ページへ）
刻印（作品ページへ）
台風一過（作品ページへ）
人生という名のSL（作品ページへ）
エピソード一覧：
- 第1章
- 第2章
- 第3章
- 第4章
- 第5章
- 第6章
- 第7章
- 第8章
- 第9章
- 第10章
- 第11章
エピソード一覧：
- 第12章
- 第13章
- 第14章
- 第15章
- 第16章
- 第17章
- 第18章
- 第19章
- 第20章
- 第21章
エピソード一覧：
- 第22章
- 第23章
- 第24章
- 第25章
- 第26章
- 第27章
- 第28章
- 第29章
- 第30章
- 第31章
- 第32章
- 第33章
- 第34章
- 第35章
- 第36章
エピソード一覧：
- 序章 山小屋に住む少年
- 第1章 追われた男と犬
- 第2章 しのびよる魔の手
- 第3章 うずもれた財宝
- 第4章 ボスザルとの対決
- 第5章 かげろうという名の男
- 第6章 サーカスの花形
- 第7章 00犬ベン
- 第8章 冒険への旅立ち
- 第9章 ウルの遠吠え
- 第10章 大首領ダーク・グレー
- 第11章 ひとりぼっちのエレーナ
エピソード一覧：
- 第12章 暗号文を解け！
- 第13章 財宝のねむる場所
- 第14章 キツネのたくらみ
- 第15章 プチの死
- 第16章 最後の戦い
- 終章 宇宙犬ベン
エピソード一覧：
- 第1章 ウマ怪獣
- 第2章 空手部入部
- 第3章 スズメバチ
- 第4章 侵略者の黒幕
エピソード一覧：
- 発端
- 化物屋敷からの電話
- 狐と狸
- 百万人の科学者
- 白骨の橋
- 火攻め
- 吸血蝙蝠
- 悪魔の饗宴
- 科学者の子
- 科学の勝利
- 魔物陳列室
エピソード一覧：
- 暴風雨
- クラゲ島
- ロボット工場
- 危機一髪
- 思はぬ味方
- ピイ子
- 怪洞窟
- ロボット動員
- 犠牲
- 火星王
- ポッポ博士の正体
- ロケットは発射された
- 大団円
エピソード一覧：
- ガス燈の町
- むじつの罪
- 盗賊ウルフ
- 伯爵家の祕密
- 脱獄
- 鬼領主
- 怪紳士登場
- 恐怖の家
- 神出鬼没
- ギブスの祕密
- 果して怪人の正体は
- 運命の日
- 追うもの 追われるもの
- はなの下のおでき
- 底なし沼の悲劇
エピソード一覧：
- プロロオグ
- ピラミッドの底の首領閣下
- おそろしい陰謀團だ
- あっ、ロケットが成層圏へ
- 海底の怪物
- 岩上の大空魔艇
- 燈台博士
- ネオゲンシニウムの祕密
- 日本は凍りつつあります
エピソード一覧：
- ホップ会社
- 暴走自動車
- 大惨事
- ちかいの言葉
- 一箇月后
- モーターカー・レース
エピソード一覧：
- 怪人深夜を歩く
- 時間機とその持主
- 一千年前の宝
- わるものども
- 生埋め
- 天佑
- ものをいう本
- 未来の王国
- 金星にすむレロ博士
- 絶対反射能
- 恐竜騒動
エピソード一覧：
- 第1章 ガラス屋敷の人々
- 第2章 二千年眠った女
- 第3章 決闘
- 第4章 死刑囚二五三五号
- 第5章 本日休業
- 第6章 豚と闖入者
- 第7章 毒をもって毒を制す
エピソード一覧：
- プロローグ
- 地獄への行進曲
- 陰謀の国ウラメシア
- 暗殺指令
- 12時20分
- 逃げろや逃げろ
- 亡命の王子
- 父と子
- 神田のうまれよ
- あくまの高笑い
- 宇宙人ミラー
- 開戦㐧1日
- 東京敗れたり
エピソード一覧：
- 魔法のガムの巻
- ガムガムとクチャクチャの巻
- 潮干狩りの巻
- ホタルの巻
- おばけの巻
- 宿題の巻
- 騒音の巻
- サンタの国の巻
- おししの巻
- お使いの巻
- お人形の宝の巻
- 留守番の巻
- 歯医者の巻
- 避暑の巻
- 台風の巻
- お月見の巻
- 学芸会の巻
- どぶさらいの巻
- チャリティーショーの巻
- 遠足の巻
- 標本の巻
- お別れの巻
エピソード一覧：
- ウマ
- タヌキ
エピソード一覧：
- その1 マコ誕生
- その2 カイジュウがほしい
- その3 迷子のアドバイス
- その4 マコのだ ルミ子のよ
- その5 よっぱらいマコ
- その6 車をぶっつけたママ
- その7 なやみのルミ子
- その8 ピアノのレッスン
- その9 キッスがブチュ
- その10 お年玉つかっちゃおう
- その11 ゴキブリネコ
- その12 親子の対話
- その13 フレンド・グラフィティ
- その14 ルミ子のゴシップ
- その15 悪魔が大好き
- その16 ジェラシーの芽ばえ
- その17 おっとりチイ子
エピソード一覧：
第一部 エネル石
- ヒゲオヤヂの記録の最初
- 或夜の惨劇
- 現場捜査
- ミイチャンの身上
- 人間敎育
- 告白
- ママンゴ星
- 偽物
- 眞逆様
- 大渦巻
第二部 植物人間
- 謎屋敷
- 詭計と謀計
- 復讐
- 袋の中の兎
- オヤヂの最後？
- 爆藥の花籠
- 植物にして霊
第三部 怪新聞記者
- 凶兆
- 豚藻の祕密
第四部 前世紀
- 探險隊
- プラテオソールス
- 植物の恋
- 運命の嵐
- 大團円
- ヒゲオヤヂの記録の最後
エピソード一覧：
第一部
- 虫プロへきた少年
- 熱海教授のひみつ
- 百の顔を持つ少年
- 父をたずねて
- さらわれた少女
- 三人のうらない師
- 追うもの追われるもの
- メガネ橋へこい！！
- メガネ橋へ！！
- 立花博士の最期
- 変身人間についての解説
- 秋芳洞の怪人
- バンパイヤ革命
- 悪魔の計算
- カラクリ屋敷のひみつ
- うらぎり
エピソード一覧：
第一部
- 丸薬バクダン
- アリゲーター氏
- 熱海教授の秘密
- 革命の日
- マッドPA
- 大団円
第二部
- 第1章 ある怪談
- 第2章 山猫少年
- 第3章 奇獣ウェコとロックとのめぐり会い
- 第4章 ヤモリ沢の怪物
- 第5章 犠牲
- 第6章 武州怪異記
- 第7章 百億円の遺産
エピソード一覧：
- 第1章 開幕
- 第2章 亜美の秘密
- 第3章 ツッパリのゲン
- 第4章 奇顔城
- 第5章 FBIの使者
- 第6章 ピエロの首
- 第7章 あにいもうと
- 第8章 殺しへの巡礼
- 第9章 湖のとりで
- 第10章 脱出作戦
エピソード一覧：
- 第1章 そもそも神かくしとは
- 第2章 アンパカ組はキモをつぶした
- 第3章 四次元にマネキンあり
- 第4章 おまえが放火犯人だ
- 第5章 人間の皮を着た人間
- 第6章 タイム・マシーンのおんぼろ事件
- 第7章 サブタン三四郎
- 第8章 アフリカ危機一髪
エピソード一覧：
- 第1章 石から生まれた孫悟空
- 第2章 三本たらない頭の毛
- 第3章 金米糖のあめん棒は金ソウ棒
- 第4章 ならのカンヌシがスルメをかんだ
- 第5章 ブタは夜おとずれる
- 第6章 黄風山の黄風洞に黄風大王が
- 第7章 坊主がお寺にじょうずに火をつけた
- 第8章 ニンジンカをたべたい
- 第9章 きれいな着物を着たい
- 第10章 火焰山のたたかい
- 第11章 キツネにつままれる
- 第12章 バケモノにも友情あり
- 第13章 馬とブタは冷凍肉にもってこい
エピソード一覧：
- 第14章 バケネコと鬼は日本の名物
- 第15章 坊主ができるのは坊主めくり
- 第16章 ティーンエイジャーに敵はなし
- 第17章 水爆坊やのわがまま
- 第18章 クモ娘のむことり
- 第19章 烏鶏国の足のある幽霊
- 第20章 霊感大王はタイ焼きがお好き
- 第21章 カボチャになった三蔵法師
- 第22章 スギ ヤナギ ケヤキの精
- 第23章 ボ××のきらいな国
- 第24章 シダ嶺の三魔王
- 第25章 牛の舌怪獣迂乱
- 第26章 悟空のメンタルテスト
エピソード一覧：
- 第27章 九つ頭のしし魔神
- 第28章 泥蓮洞のかたきうち
- 第29章 泥棒十二人組
- 第30章 かげろう大王
- 第31章 ヒヤリ仙人の不良生徒
- 第32章 五霊元聖
- 第33章 平妖殿の七ふしぎ
- 第34章 毒敵山のデクノボウ公司
- 第35章 ブリンナーの三蔵
- 第36章 天漢道士
- 第37章 天竺
エピソード一覧：
- 第1章 帰郷
- 第2章 祝殿
- 第3章 加東という男
- 第4章 時の亀裂
- 第5章 轢死体
- 第6章 烙印
- 第7章 擬態
- 第8章 窖
- 第9章 証言
- 第10章 生ける屍
- 第11章 動乱の翳
- 第12章 さなぎ
- 第13章 人形の家
- 第14章 泥流
- 第15章 光陰
エピソード一覧：
- 足伏が原
- くろぬし屋
- 天敵来襲
- 大地は怒る
- こがねの泥沼
- 官軍侵入
エピソード一覧：
- 奇蹟の森は大さわぎになった
- ダリヤ大公の邸は大宴会が開かれた
- 王子ロビン・キッドはついに捕われた
- 木登り姫
- 盗賊ルイジ・バンバと一本橋の上でであった
- ロビン・キッド山賊の首領となる
- 沈没船の中に一つ目の怪魚
- ミルク島
- ブライアローズがふしぎな病気に
エピソード一覧：
- 世界一周第一歩
- 黒い豚と好好大人
- インド珍道中
- 四千年の大殿堂
- 君よ知るや南の国
- パリーの“2つの顔”
- ニューヨーク大さわぎ
エピソード一覧：
- 序章 王道楽土
- 第1章 拳匪の群
- 第2章 烙印
- 第3章 掃滅
- 第4章 白河のほとり
- 第5章 蟷螂
- 第6章 変身
- 第7章 黄帝魂
- 第8章 日本へ（一）
- 第9章 日本へ（二）
- 第10章 黒龍会（一）
- 第11章 黒龍会（二）
エピソード一覧：
- 第12章 本郷だんご坂（一）
- 第13章 本郷だんご坂（二）
- 第14章 戦雲
- 第15章 純正社会主義
エピソード一覧：
第1部
- 第1章 むかしむかし
- 第2章 おかしな武芸者
- 第3章 お萩とボタ松
- 第4章 たたかいの日日
- 第5章 十郎潟の竜
- 第6章 フクベ党のたくらみ
- 第7章 子安貝をもとめて
- 第8章 星姫と月姫
- 第9章 久呂岳の決闘